（一）辦公室（黨委辦公室）

承擔黨委辦公室職責；承擔機關日常運轉，承辦安全保衛、機要保密、信訪接待、政務公開等工作；承擔科技管理、網絡及信息系統安全等工作。

（二）人事政工科（黨委組織宣傳部）

承擔黨委組織宣傳部職責；承擔干部人事、機構編制、海關關銜、勞動工資、教育培訓和離退休干部工作；承擔基層黨組織建設、群團工作，開展思想政治工作和文化建設。

（三）財務科

承擔財務管理、預決算管理、關務保障等工作。

（四）法規科

落實法治海關建設，牽頭指導法制工作，組織開展法制宣傳，歸口管理法律顧問、公職律師、司法調查工作，承擔執法資格管理、合法性審查、復議應訴工作，承擔重大行政處罰案件的法制審查和檢驗檢疫一般程序案件辦理工作、知識產權海關保護、打擊進出口假冒偽劣商品工作，承擔企業經營異常、稅收保全和強制工作，牽頭標準化工作。

（五）綜合業務科

承擔全關業務綜合協調、業務改革推進、統籌口岸開放、“單一窗口”建設職責；承辦全關（2316、2330、2385場地號）通關監管的現場綜合業務工作、驗估工作；除泰興市證單簽證管理、原產地簽證工作。

（六）查檢一科

承擔泰州海關轄區動植物檢驗檢疫監管、食品檢驗檢疫監管工作；承擔泰州地區（含靖江市）特殊物品日常后續監管。

（七）查檢二科

承擔泰州海關轄區除煤炭、化工品及其包裝檢驗監管查驗以外的商品檢驗監管工作。

（八）稽查科

承擔常規稽查、專項稽查等。

（九）核查科

承擔保稅監管、關稅、企業管理、統計、口岸監管事務、動植物檢疫監管、商品檢驗監管、進出口食品安全監管業務的核查工作；貿易調查、市場調查及企業主動披露管理。

（十）關稅科

承擔稅收征管統籌協調、稅則調研、減免稅審批、屬地納稅人管理、公自用物品審批職責。

（十一）統計分析科

承擔貿易統計、業務統計、統計分析、統計監督、報關單數據管理等工作，組織開展政策研究工作，承擔企業信息公共服務平臺建設。

（十二）企業管理科

承擔通用資質的企業及相關從業人員注冊登記和備案管理；承擔特定資質的企業及相關從業人員、貨物、物品注冊登記和備案管理；行政審批“一個窗口”；承擔泰州地區（含靖江市）特殊物品審批。

（十三）保稅監管科

承擔除綜合保稅區以外的企業加工貿易及保稅監管業務的備案核銷現場事務、保稅倉庫管理、出境加工監管、新興業態保稅監管。

（十四）審核科

承擔稽查、核查、主動披露作業審核、復核；稽查、核查、主動披露工作指導和監督；稽查執法疑難問題研究；引入中介機構稽核查職責。

（十五）跨境電商監管科

承擔跨境電商業務監管工作。

（十六）特殊區域管理科

承擔綜合保稅區區內加工貿易及保稅監管業務管理、監管、查驗、放行、檢驗檢疫等職責；開展綜合保稅區績效評估等事中事后監督。

（十七）督察內審科

承擔督察審計、內控機制建設、執法評估等工作。

（十八）泰興辦事處

承擔本部門基層黨的建設和隊伍管理工作；承擔泰州海關轄區內的口岸監管業務。

（十九）泰興辦事處綜合業務科

承擔泰興市證單簽證管理、原產地簽證工作；辦事處綜合保障性事務。

（二十）泰興辦事處監管一科

承擔泰州海關轄區物流監控、監管場所管理、口岸衛生監督和口岸核心能力建設（含靖江）工作；全關口岸監管業務日常運行監控指揮職責；免稅商店監管；泰州地區（含靖江市）應急處置突發公共衛生事件、特殊物品監督管理和出入境人員傳染病檢測業務。

（二十一）泰興辦事處監管二科

承擔泰州海關轄區衛生檢疫、運輸工具、行李物品、供船物料監管。

（二十二）泰興辦事處查驗一科

承擔泰州海關轄區（不含綜保區）集裝箱查驗工作；H986設備使用管理工作。

（二十三）泰興辦事處查驗二科

承擔泰州海關轄區煤炭、化工品及其包裝檢驗監管查驗工作。